La cromatografía líquida (HPLC) y la cromatografía de gases (GC) se utilizan ampliamente en educación, investigación científica, productos farmacéuticos, pesticidas, protección ambiental, prevención de epidemias, inspección de productos básicos, alimentos, piensos, petroquímicos, carbón, tintes, productos químicos finos, bioingeniería y muchas otras industrias.
HPLC utiliza una fase móvil líquida y analiza sustancias que se pueden disolver en un líquido. La GC utiliza un gas (gas portador) como fase móvil y analiza sustancias que pueden vaporizarse a alta temperatura.
En pocas palabras, la GC "transporta" la muestra como gas, mientras que la HPLC "transporta" la muestra como líquido. Los diferentes medios de transporte determinan qué muestras se pueden transportar y qué métodos analíticos se utilizan.

GC
Adecuado para muestras que pueden vaporizarse, que tienen buena estabilidad térmica y puntos de ebullición bajos.
No se puede utilizar para muestras iónicas o poliméricas de alto punto de ebullición, poco volátiles, térmicamente inestables.
La GC sólo puede analizar entre el 15% y el 20% de los compuestos orgánicos.
HPLC
Adecuado para muestras que se pueden disolver para formar una solución.
Puede analizar muestras iónicas, poliméricas, poco volátiles, térmicamente inestables y de alto peso molecular, así como sustancias fisiológicamente activas.
Ampliamente aplicable: cubre entre el 80% y el 85% de los compuestos orgánicos.
GC
La fase móvil es un gas.
La fase móvil no suele ser tóxica y es fácil de manipular.
La fase móvil no tiene afinidad por los componentes de la muestra; interactúa sólo con la fase estacionaria y no participa en el equilibrio de partición.
HPLC
La fase móvil es un líquido.
La mayoría de las fases móviles son tóxicas.
Contamina fácilmente el medio ambiente.
Mayor costo.
La fase móvil tiene afinidad por los componentes de la muestra, lo que mejora la selectividad y resolución de la columna, desempeñando un papel importante en la separación.
Hay disponible una amplia variedad de fases móviles, que ofrecen muchas opciones.
La polaridad y el pH de la fase móvil afectan significativamente la separación.
Se pueden mezclar dos o más líquidos en diferentes proporciones como fase móvil, lo que aumenta la selectividad de separación.
GC: Muchos tipos disponibles.
HPLC: Menos tipos que para GC.
GC: Las columnas capilares pueden alcanzar una eficiencia de columna muy alta.
HPLC: Las columnas no pueden ser muy largas, por lo que su eficiencia es relativamente menor.
GC: La fase móvil no afecta la partición; la selectividad se cambia principalmente variando la fase estacionaria y la temperatura de la columna.
HPLC: La selectividad se cambia principalmente variando la fase móvil.
GC: Ofrece detectores selectivos de alta sensibilidad, así como detectores universales de sensibilidad moderada.
HPLC: Ofrece detectores universales moderadamente sensibles.
GC: Calentado (temperatura elevada).
HPLC: Temperatura ambiente.
GC: Más fácil.
HPLC: Ligeramente más complejo que GC.
GC: Construcción más sencilla que HPLC.
HPLC: Construcción más compleja.
GC: La muestra se destruye; la recuperación es difícil.
HPLC: La muestra no se destruye; La recuperación es fácil y puede ser cuantitativa, adecuada para el trabajo preparatorio.
La HPLC puede lograr separaciones más difíciles. En la GC, el gas portador es inerte, no participa en el equilibrio de partición y no tiene afinidad por los componentes; sólo interactúa la fase estacionaria. En HPLC, la fase móvil tiene afinidad por los componentes, lo que mejora la selectividad y la resolución de la columna. El uso de dos o más líquidos en diferentes proporciones como fase móvil aumenta la selectividad de separación. La HPLC suele funcionar a temperatura ambiente, lo que resulta favorable para elegir las condiciones de separación.
Siempre que se puede analizar una muestra mediante GC, generalmente se prefiere porque la GC es más rápida, más sensible, más conveniente y menos costosa.
En lugar de memorizar parámetros, simplemente hazte tres preguntas y decidirás rápidamente.
¿Puede la muestra “soportar altas temperaturas”? ¿Se puede vaporizar?
Sí – por ejemplo, medir componentes en gasolina, constituyentes en sabores: elija GC. Es rápido, preciso y ahorra disolvente.
No – por ejemplo, el análisis de glucósidos en la medicina tradicional china (se descomponen al calentarlos), proteínas en la sangre: sólo la HPLC es suficiente: suave y no destructiva.
¿La muestra es “voluminosa”? (¿Peso molecular > 500?)
Sí – por ejemplo, análisis de ADN, polímeros, fármacos con anticuerpos: elija HPLC directamente. GC no puede manejar moléculas grandes.
No – entonces considere también la volatilidad. Para moléculas volátiles pequeñas (p. ej., etanol), utilice GC; para moléculas pequeñas no volátiles (p. ej., azúcares), utilice HPLC.
¿La muestra está “cargada”? (Iónico o muy polar)
Sí – por ejemplo, medir iones de cloruro o sulfato en agua: elija HPLC (modo de cromatografía iónica): esa es su fuerza especial.
HPLC y GC nunca han sido competidores; son “compañeros de oro” en el laboratorio.
GC es el “velocista para moléculas pequeñas”, y se especializa en muestras que pueden vaporizarse y son termoestables: separación rápida a bajo costo.
La HPLC es el “guardián de las moléculas grandes” y protege las muestras sensibles al calor o voluminosas: suave, precisa y no destructiva.
La próxima vez que se enfrente a una muestra, primero comprenda su “personalidad”: ¿se puede vaporizar a alta temperatura? ¿Qué tan grande es su peso molecular? ¿Está cargado? Luego elija el “vehículo” adecuado: su trabajo analítico será dos veces más eficiente con la mitad de esfuerzo.